Вторая фаза проекта, предусматривающая укрепление Кокаральской дамбы и восстановление дельты реки Сырдарьи, реализуется с 2022 года. Намечено увеличить объем воды в Малом (Северном) Аральском море до 35 млрд. кубометров.